MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p1

Total Repeats: 43488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016594	CGT	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377158
2	NC_016594	GCA	2	6	164	169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377158
3	NC_016594	GCT	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377158
4	NC_016594	CGC	3	9	290	298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377158
5	NC_016594	GAA	2	6	308	313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377158
6	NC_016594	CGC	2	6	329	334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377158
7	NC_016594	TCC	2	6	352	357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392377158
8	NC_016594	AAG	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377158
9	NC_016594	GC	3	6	482	487	0 %	0 %	50 %	50 %	392377158
10	NC_016594	GGA	2	6	509	514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377158
11	NC_016594	GGC	2	6	522	527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377158
12	NC_016594	ATC	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392377158
13	NC_016594	CGC	2	6	589	594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377158
14	NC_016594	CAT	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392377158
15	NC_016594	AGC	2	6	625	630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377158
16	NC_016594	GAA	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377158
17	NC_016594	GC	3	6	649	654	0 %	0 %	50 %	50 %	392377158
18	NC_016594	TCGCCA	2	12	655	666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392377158
19	NC_016594	TGA	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392377158
20	NC_016594	ACC	2	6	694	699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377158
21	NC_016594	GC	3	6	712	717	0 %	0 %	50 %	50 %	392377158
22	NC_016594	AAG	2	6	744	749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377158
23	NC_016594	TGC	2	6	772	777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377158
24	NC_016594	TCATCG	2	12	817	828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392377159
25	NC_016594	GCG	2	6	829	834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377159
26	NC_016594	GGC	2	6	840	845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377159
27	NC_016594	GGC	2	6	851	856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377159
28	NC_016594	GCC	2	6	864	869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377159
29	NC_016594	GGT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392377159
30	NC_016594	CGG	2	6	911	916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377159
31	NC_016594	CCG	2	6	964	969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377159
32	NC_016594	TGC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377159
33	NC_016594	CGG	2	6	1082	1087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377159
34	NC_016594	CTG	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377159
35	NC_016594	AAG	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377159
36	NC_016594	GCT	2	6	1142	1147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377159
37	NC_016594	GCG	2	6	1182	1187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377159
38	NC_016594	GAA	2	6	1205	1210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377159
39	NC_016594	CAT	3	9	1211	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392377159
40	NC_016594	GCGCCC	2	12	1228	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377159
41	NC_016594	GGA	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377159
42	NC_016594	ACG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377159
43	NC_016594	GCT	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377159
44	NC_016594	GGT	2	6	1397	1402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392377159
45	NC_016594	CGAGGA	2	12	1430	1441	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392377159
46	NC_016594	CAT	2	6	1487	1492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392377159
47	NC_016594	CGGTGG	2	12	1540	1551	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	392377159
48	NC_016594	GACC	2	8	1655	1662	25 %	0 %	25 %	50 %	392377159
49	NC_016594	CGA	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377159
50	NC_016594	GTGAC	2	10	1723	1732	20 %	20 %	40 %	20 %	392377159
51	NC_016594	GCCA	2	8	1758	1765	25 %	0 %	25 %	50 %	392377159
52	NC_016594	GTCG	2	8	1865	1872	0 %	25 %	50 %	25 %	392377159
53	NC_016594	GAA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377159
54	NC_016594	AGG	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377159
55	NC_016594	CGGCAA	2	12	1937	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377159
56	NC_016594	ACC	2	6	2088	2093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377159
57	NC_016594	GAT	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392377159
58	NC_016594	CCAG	2	8	2569	2576	25 %	0 %	25 %	50 %	392377160
59	NC_016594	GCTCAA	2	12	2609	2620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392377160
60	NC_016594	GAG	2	6	2631	2636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377160
61	NC_016594	GCC	2	6	2637	2642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377160
62	NC_016594	AAGCAC	2	12	2667	2678	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392377160
63	NC_016594	CGT	3	9	2816	2824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377160
64	NC_016594	CGA	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377160
65	NC_016594	GGA	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377160
66	NC_016594	CGG	2	6	2855	2860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377160
67	NC_016594	GCG	2	6	2898	2903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377160
68	NC_016594	ACC	2	6	2913	2918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377160
69	NC_016594	AGA	3	9	2944	2952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377160
70	NC_016594	GGT	3	9	2966	2974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392377160
71	NC_016594	CCGCG	2	10	3013	3022	0 %	0 %	40 %	60 %	392377160
72	NC_016594	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377160
73	NC_016594	GA	3	6	3139	3144	50 %	0 %	50 %	0 %	392377160
74	NC_016594	AGG	3	9	3148	3156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377160
75	NC_016594	GAC	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377160
76	NC_016594	GC	3	6	3179	3184	0 %	0 %	50 %	50 %	392377160
77	NC_016594	CGG	2	6	3241	3246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377160
78	NC_016594	GAA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377160
79	NC_016594	TGG	2	6	3316	3321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392377160
80	NC_016594	CGC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377160
81	NC_016594	ACGC	2	8	3470	3477	25 %	0 %	25 %	50 %	392377161
82	NC_016594	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392377161
83	NC_016594	CGC	2	6	3568	3573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377161
84	NC_016594	CCG	3	9	3580	3588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377161
85	NC_016594	GATGT	2	10	3596	3605	20 %	40 %	40 %	0 %	392377161
86	NC_016594	CCG	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377161
87	NC_016594	AAC	2	6	3725	3730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392377161
88	NC_016594	GCG	2	6	3756	3761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377161
89	NC_016594	GTTCC	2	10	3790	3799	0 %	40 %	20 %	40 %	392377161
90	NC_016594	TGC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377161
91	NC_016594	AGA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377161
92	NC_016594	GCG	2	6	3914	3919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377161
93	NC_016594	CGGG	2	8	3975	3982	0 %	0 %	75 %	25 %	392377162
94	NC_016594	GGC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377162
95	NC_016594	CGG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377162
96	NC_016594	CCG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377162
97	NC_016594	CGC	2	6	4130	4135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377162
98	NC_016594	CGCCAC	2	12	4206	4217	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	392377162
99	NC_016594	GGC	2	6	4255	4260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377162
100	NC_016594	CCA	2	6	4313	4318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377162
101	NC_016594	GCC	2	6	4362	4367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377162
102	NC_016594	CGG	2	6	4379	4384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377162
103	NC_016594	AGC	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377162
104	NC_016594	GGC	2	6	4428	4433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377162
105	NC_016594	CGC	2	6	4577	4582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377163
106	NC_016594	CGT	3	9	4605	4613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377163
107	NC_016594	CG	4	8	4661	4668	0 %	0 %	50 %	50 %	392377163
108	NC_016594	GAT	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392377163
109	NC_016594	CCGC	2	8	4737	4744	0 %	0 %	25 %	75 %	392377163
110	NC_016594	CG	3	6	4745	4750	0 %	0 %	50 %	50 %	392377163
111	NC_016594	CCG	2	6	4763	4768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377163
112	NC_016594	GC	3	6	4784	4789	0 %	0 %	50 %	50 %	392377163
113	NC_016594	GCGCC	2	10	4795	4804	0 %	0 %	40 %	60 %	392377163
114	NC_016594	GC	3	6	4853	4858	0 %	0 %	50 %	50 %	392377163
115	NC_016594	CGC	2	6	4940	4945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377163
116	NC_016594	CG	3	6	5028	5033	0 %	0 %	50 %	50 %	392377163
117	NC_016594	GTC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377163
118	NC_016594	GTC	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377163
119	NC_016594	TCC	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392377163
120	NC_016594	CCG	2	6	5126	5131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377163
121	NC_016594	CGT	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377163
122	NC_016594	CGG	2	6	5153	5158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377163
123	NC_016594	GGAAGC	2	12	5186	5197	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392377163
124	NC_016594	GC	3	6	5212	5217	0 %	0 %	50 %	50 %	392377163
125	NC_016594	TCT	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392377163
126	NC_016594	CGG	2	6	5291	5296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377163
127	NC_016594	GGGT	2	8	5308	5315	0 %	25 %	75 %	0 %	392377163
128	NC_016594	GCGG	2	8	5360	5367	0 %	0 %	75 %	25 %	392377163
129	NC_016594	CGT	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377163
130	NC_016594	CCG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377163
131	NC_016594	TGA	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392377163
132	NC_016594	GCA	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377163
133	NC_016594	CGC	2	6	5627	5632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377163
134	NC_016594	CGG	2	6	5651	5656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377163
135	NC_016594	CGA	2	6	5657	5662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377163
136	NC_016594	CTG	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377164
137	NC_016594	ATC	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392377164
138	NC_016594	CGGT	2	8	6011	6018	0 %	25 %	50 %	25 %	392377164
139	NC_016594	GCCGG	2	10	6054	6063	0 %	0 %	60 %	40 %	392377164
140	NC_016594	CGC	2	6	6134	6139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377164
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142	NC_016594	GC	3	6	6166	6171	0 %	0 %	50 %	50 %	392377164
143	NC_016594	GGC	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377164
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146	NC_016594	CTG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377164
147	NC_016594	CAG	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377164
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149	NC_016594	TCA	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392377164
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152	NC_016594	CTCG	2	8	6359	6366	0 %	25 %	25 %	50 %	392377164
153	NC_016594	TCC	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392377164
154	NC_016594	CGC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377164
155	NC_016594	GAGC	2	8	6443	6450	25 %	0 %	50 %	25 %	392377164
156	NC_016594	GC	3	6	6538	6543	0 %	0 %	50 %	50 %	392377164
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159	NC_016594	GCT	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377164
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161	NC_016594	TCG	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377164
162	NC_016594	CGG	2	6	6596	6601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377164
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164	NC_016594	GCGG	2	8	6634	6641	0 %	0 %	75 %	25 %	392377164
165	NC_016594	CG	3	6	6647	6652	0 %	0 %	50 %	50 %	392377164
166	NC_016594	CTG	3	9	6672	6680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377164
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173	NC_016594	GGT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392377165
174	NC_016594	TTC	2	6	7194	7199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392377165
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258	NC_016594	ATT	2	6	10278	10283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392377167
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263	NC_016594	TCG	2	6	13004	13009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377168
264	NC_016594	ACG	2	6	13010	13015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377168
265	NC_016594	ACG	2	6	13052	13057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377168
266	NC_016594	CG	3	6	13070	13075	0 %	0 %	50 %	50 %	392377168
267	NC_016594	GCC	2	6	13078	13083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377168
268	NC_016594	CG	3	6	13113	13118	0 %	0 %	50 %	50 %	392377168
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284	NC_016594	GCCGG	2	10	13547	13556	0 %	0 %	60 %	40 %	392377168
285	NC_016594	TCG	2	6	13565	13570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377168
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302	NC_016594	CGG	2	6	14268	14273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377168
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377	NC_016594	GATC	2	8	17121	17128	25 %	25 %	25 %	25 %	392377172
378	NC_016594	CTC	3	9	17151	17159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392377172
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381	NC_016594	GGA	2	6	17301	17306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377172
382	NC_016594	CGC	2	6	17313	17318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377172
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385	NC_016594	CCG	2	6	17479	17484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377173
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388	NC_016594	CG	3	6	17509	17514	0 %	0 %	50 %	50 %	392377173
389	NC_016594	ACA	2	6	17533	17538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392377173
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391	NC_016594	GGA	2	6	17615	17620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377173
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497	NC_016594	CG	3	6	22025	22030	0 %	0 %	50 %	50 %	392377180
498	NC_016594	CCG	2	6	22061	22066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377180
499	NC_016594	CGACGC	2	12	22249	22260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392377181
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